菏澤站第一代候車室，1977年12月新兗鐵路開工，1980年初建成通車，開通初期，旅客列車少，大部分時(shí)間廣場都是空蕩蕩的，車站廣場成了附近村民的涼曬場。（資料照片，翻拍于菏澤市圖書館，原作者不祥） 

1996年9月1日，京九鐵路開通,菏澤站舉行了隆重的開通儀式。京九與新兗在菏澤交匯，菏澤區(qū)域樞紐凸顯。（照片由宿燕提供）

隨著京九鐵路的開通，第一代候車已不能滿足人們的出行需求，第二代候車室于2004年建成投入使用，由于設(shè)計(jì)起點(diǎn)不高，后續(xù)配套設(shè)施也不完善，投入使用后就滿足不了人們的出行需求。

2011年菏澤站春運(yùn)，由于候車室面積小，高峰時(shí)段需要提前拉出部分旅客在站臺候車，以緩解候車室壓力。

2013年年初，在千呼萬喚中菏澤站迎來了第三提升改造，為了不影響人們出行，站改采取了邊施工邊運(yùn)營的方式。

2014年7月菏澤站第三代候車室建成并投入使用新候車室宏偉大氣，總面積15000平方米，功能設(shè)施先進(jìn)，方便了菏澤人民的出行。

2020年國慶小長假返程的旅客，電子客票已全面到來，旅客刷身份證就可以進(jìn)站上車。

隨著生活進(jìn)入快節(jié)奏，普速鐵路已經(jīng)滿足不了人們的出行需求，2018年12月10日，魯南高鐵曲阜至菏澤段在菏澤高鐵站打下了第一根樁，菏澤的高鐵建設(shè)拉開序幕。

2019年6月11日，魯南高鐵曲阜至菏澤段架設(shè)起第一榀箱梁，高鐵建設(shè)步入快車道。

2020年10月建設(shè)中的菏澤高鐵站。

2021年3月15日，魯南高鐵曲阜至菏澤段開始鋪軌，魯西南人民的高鐵夢不再遙遠(yuǎn)。

2021年5月，菏澤高鐵站進(jìn)入鋼結(jié)構(gòu)吊裝階段，菏澤高鐵站雛形已現(xiàn)。